El año es 2009, y las selvas de Cuba nunca tuvieron este tipo de calor... y tensión. La revolución está teniendo lugar mientras un señor de la guerra financiado por las drogas se prepara para tomar el control del territorio. Un grupo de seis boinas verdes de élite del ejército de los EE. UU., más conocidos como Ghosts, están desplegados y listos para estropear los planes de los malos. Además de las campañas para un solo jugador, el juego también presenta el juego en pantalla dividida y varios modos multijugador diferentes para jugar en línea.
El juego también incluye la campaña de Tom Clancy's Ghost Recon: Island Thunder solo para abarcar el conflicto y darles a los jugadores lo que antes estaba mal para PlayStation 2. Al controlar equipos Alpha y Bravo de tres por tres, ahora puede dar órdenes a ambos equipos a través de auriculares USB mientras lucha de primera mano mediante el uso de un gamepad. El reconocimiento de voz admite alrededor de 50 comandos diferentes dados en una forma de concatenación QUIÉN+QUÉ+DÓNDE (por ejemplo, Alpha Team Take Cover, o All Teams Attack Objective 2).