Es el año 2013 y juegas como el Capitán Mitchell, comandante de un equipo Ghost Recon, en una misión en la Ciudad de México donde los rebeldes intentan un golpe de estado, poniendo en peligro a México y Estados Unidos.
Para hacer frente a las diferentes situaciones a las que tienes que enfrentarte, sacando armas AA o defendiendo al personal herido hasta que llegue el equipo de rescate, no solo tienes acceso a armas de primer nivel como las diferentes versiones del MR-C, sino también a equipo futurista como un dron que vuela sobre el campo de batalla para detectar unidades enemigas.
La versión para PC se desarrolló casi independientemente de la versión de Xbox 360, por lo que existen diferencias notables entre las dos. Los cambios más importantes se pueden encontrar en el diseño de Cross-com. Se divide en 3 partes: la lista de soporte, los comentarios en video y el sistema de pedidos. La lista de soporte siempre se muestra en su HUD y le permite ver todas las unidades a su disposición en todo momento. A través del sistema de pedidos, puede darles comandos sobre la marcha. La sección de comentarios en video te permite ver a través de los ojos de uno de los miembros de tu equipo, pero a diferencia de la versión de Xbox 360, solo ves formas aproximadas del entorno. Para verlo en todo su esplendor, debe vincularse completamente a la transmisión de video, que luego obstruye su propia vista.
El mapa táctico le permite ver una transmisión satelital del área de la misión y proporciona microgestión para su equipo al establecer puntos de referencia para cada miembro del equipo y decidir cuándo ejecutarlos. También puede detectar enemigos temprano cuando están en campo abierto, para planificar mejor su ruta de ataque.
Otras diferencias con la versión de Xbox 360 incluyen la falta de una vista en tercera persona, junto con el rifle de francotirador que tiene un alcance en la versión de Xbox 360 para detectar enemigos a través de las paredes. En la versión para PC, los niveles son mucho más grandes y se modificaron para permitir más posibilidades tácticas, que son muy necesarias ya que la IA es mucho más inteligente en la versión para PC.
Antes de cada misión, puedes equipar a tu escuadrón con diferentes armas. Hay espacio para múltiples armas, pero cada miembro tiene un peso máximo que puede llevar y también influye en la rapidez con la que se fatiga al correr. Su armamento se puede modificar con silenciadores, empuñaduras frontales, miras de punto rojo o lanzagranadas. También se pueden llevar municiones adicionales. Durante las peleas, puedes recolectar munición de oponentes muertos, pero no las armas en sí.
Cuando estés cansado de la IA de tus compañeros de equipo, puedes jugar todo el juego en el modo cooperativo para hasta 4 jugadores (los jugadores que faltan son reemplazados por bots) o jugar contra hasta 32 jugadores (16 más que la Xbox 360 versión) en el modo Dominación donde dos equipos de Fantasmas luchan por el control de diferentes zonas, esparcidas por el mapa y conectadas por líneas de suministro.