La humanidad abandonó la Tierra hace 80 años para construir una vida en el planeta E.D.N. tercero A medida que la colonia crecía, la humanidad se encontró con los Akrid, una raza alienígena parecida a un insecto que declaró la guerra a los humanos por entrometerse en su territorio. Los humanos no tenían medios efectivos para defenderse y tuvieron que retirarse del planeta. Durante el transcurso del retiro, un joven llamado Adam hizo que su padre fuera asesinado por un Akrid llamado "Ojo Verde". Los científicos pronto descubrieron que los Akrids eran una fuente de valiosa energía térmica, almacenada dentro de sus cuerpos. Este recurso necesario le dio a la humanidad una razón económica para defenderse. En la Tierra, se desarrolló el Vital Suit, un vehículo pesado parecido a un robot, que regresa a E.D.N. III, Adam se encuentra entre los muchos pilotos de Vital Suit y busca vengar la muerte de su padre.
Lost Planet: Extreme Condition es un shooter en tercera persona. Controlando a Adam, el jugador declara la guerra a los ejércitos de Akrid. El principal objetivo de Adam es destruir las colmenas de Akrid y, en última instancia, derrotar a "Green Eye", pero habrá varios objetivos que deberá completar en el camino. Adam puede sostener dos armas y un tipo de granada al mismo tiempo. Además, Adam puede encontrar diferentes actualizaciones de Vital Suit para obtener nuevas habilidades. Dado que hace mucho frío en el planeta, se necesita energía térmica para sobrevivir y restaurar la energía de la salud. Para obtenerlo, Adam puede activar las publicaciones de datos o destruir las cosas que lo contienen, como barriles explosivos o Akrids enemigos. La energía térmica almacenada disminuye lentamente con el tiempo y necesita una reposición constante.
Lost Planet: Extreme Condition también presenta un modo multijugador en el que los jugadores pueden conectarse en línea y jugar en cuatro modos de juego diferentes contra hasta otros 16 jugadores. Además de los habituales Deathmatch y Team-deathmatch; está "Control de la estación", donde los jugadores intentan encontrar y activar publicaciones de datos en el mapa y "Fugitivo", donde un jugador huye de todos los demás matando a los oponentes y esperando que el temporizador termine la cuenta regresiva.