Just Cause 3 es el tercer juego principal de la serie de acción ambientado en un entorno de mundo abierto centrado en disparar, causar destrucción y violencia y acrobacias exageradas. El protagonista vuelve a ser el mexicano Rico Rodríguez. Ambientada seis años después de los eventos del juego anterior., Rico regresa a Medici, la isla mediterránea ficticia donde creció hasta que el dictador general Sebastiano Di Ravello tomó el control. La historia principal lo ve formar equipo con el científico Dimah al-Masri y su ex amigo de la infancia Mario Frigo. Trabajan para la rebelión que busca derrocar a Di Ravello y frustrar sus planes de apoderarse del mundo entero. Sin embargo, al principio, Rico necesita sabotear muchas operaciones y ayudar a establecer la influencia de la rebelión, antes de que el dictador pueda ser enfrentado. El agente Sheldon del juego anterior también regresa.
Como en los juegos anteriores, Rico es capaz de hacer todo por sí mismo en la mayoría de las situaciones. En lugar de seguir las misiones principales, las islas se pueden explorar sin límites de inmediato. El entorno es ahora un archipiélago en lugar de una sola isla. Medici se divide en varias regiones, luego en provincias y aún más en asentamientos. Para liberar una provincia entera, todos los asentamientos deben ser liberados. Esto se suele hacer tomando (es decir, haciendo estallar) un centro de mando, que suele ser una gran base militar con fuerzas pesadas. También existen otras actividades para liberar un asentamiento, como derribar vallas publicitarias o estatuas, desactivar mensajes de propaganda o tomar la comisaría local. Cuando se completan todas las actividades requeridas, se iza la bandera rebelde y se toma el asentamiento.
Rico puede usar cualquier vehículo en el juego, como automóviles, pero también tanques, barcos, aviones de combate y helicópteros de ataque. Después de desbloquearlos, puede llamar a las entregas de suministros rebeldes para que le entreguen un vehículo determinado. En algunos casos, la IA adapta el nivel de dificultad para que coincida con el vehículo elegido. Las gotas también se pueden usar para armas y equipos. No hay moneda en el juego. Los elementos de retorno importantes son el paracaídas para sumergirse y el gancho de agarre para moverse rápidamente por el entorno o hacer autostop. Muchos vehículos se pueden personalizar y utilizar como armas, además de las armas a distancia habituales, como ametralladoras, rifles y lanzamisiles. A diferencia del juego anterior, C4 ahora está siempre disponible y con un suministro infinito, pero solo se pueden usar cinco simultáneamente. Completamente nuevo es el traje de alas como medio de transporte. El gancho también se usa para enganchar dos artículos o vehículos, y luego se reduce el cable para unirlos, lo que a menudo causa estragos. Hay muchas actualizaciones para desbloquear, por ejemplo, hacer que el gancho sea mucho más efectivo y permitir más a la vez. Casi cualquier acción se registra en tablas de clasificación en línea para realizar comparaciones en todo el mundo. También hay muchos desafíos que animan al jugador a experimentar a través de minijuegos y carreras.