Final Fantasy Fables: Chocobo's Dungeon , cuenta la historia de dos habituales de Final Fantasy, que ahora se han convertido en cazadores de tesoros, Cid y Chocobo, mientras son transportados mágicamente a un pueblo donde los recuerdos de la gente del pueblo están siendo robados por el sonido de una torre de reloj. Allí encuentran a un niño llamado Raffaello, que es inmune a la pérdida de memoria, y descubren que ha almacenado los recuerdos de la gente del pueblo de forma segura en una serie de mazmorras. El niño recluta a Cid y Chocobo para recuperar estos recuerdos y devolvérselos a la gente.
El juego consiste principalmente en explorar mazmorras y derrotar enemigos y jefes en batallas para ganar puntos de experiencia y subir de nivel. El juego no solo presenta exploración, sino también un sistema de trabajo, donde los jugadores pueden realizar tareas para clases de trabajo como magos negros, caballeros y eruditos. Al completar estas tareas, obtendrás habilidades laborales para luchar contra los enemigos en las mazmorras de los juegos. Los jugadores también pueden desbloquear clases de trabajo y mazmorras especiales recolectando letras esparcidas por las mazmorras; una vez que deletreen una frase para esa especialidad, se desbloqueará.
¡Los jugadores también pueden luchar entre sí usando la conexión Wi-Fi de Nintendo en batallas de cartas que recuerdan a Yu-Gi-Oh! . Los jugadores también pueden jugar minijuegos en solitario en "Mog House", que utiliza el mando de Wii.
Se lanzó un puerto degradado con contenido nuevo para Nintendo DS bajo el título Cid to Chocobo no Fushigi na Dungeon: Toki Wasure no Meikyuu DS+ , y se lanzó un lanzamiento mejorado con el contenido de la versión DS para PlayStation 4 y Switch como Chocobo's Mystery Dungeon. : ¡Cada amigo! .