Cuando una niña del pueblo enferma después de una fiesta de cumpleaños, el héroe tiene que ir a la ciudad a buscar medicinas. Y luego, evento tras evento, se embarca en una búsqueda que revelará la historia de este pueblo en el bosque, de los aldeanos, del mundo que los rodea.
Al comienzo del juego, el jugador debe crear al Héroe, eligiendo un hombre o una mujer de una de las cuatro razas en el universo de Crystal Chronicles: los veloces Selkies que pueden realizar doble salto y son eficientes arqueros, los expertos Yukes y sus superiores. potencia mágica, los fuertes Lilties para las peleas cuerpo a cuerpo y los hábiles Clavats que pueden hacer un poco de todo.
El juego en sí consiste en aventurarse a través de mazmorras, luchar contra varios enemigos y jefes mediante ataques cuerpo a cuerpo o a distancia y varios hechizos, y completar algunos acertijos. Al hacerlo, el jugador puede contratar hasta tres guardaespaldas personalizables para acompañar al personaje principal. Es posible tomar el control de cualquiera de estos personajes en cualquier momento del juego. Se pueden crear más guardaespaldas y se pueden cambiar dentro y fuera del grupo.
En la ciudad principal también hay una tienda de misiones donde solo un personaje puede ingresar y completar varias tareas para ganar dinero y materiales raros para crear nuevos equipos.
Se puede acceder al modo multijugador en cualquier punto de guardado a través de Wi-Fi o conexión inalámbrica a Internet, y se puede invitar a hasta tres amigos (que ocupan el lugar de los guardaespaldas) en el juego. Los nuevos jugadores pueden ayudar en las mazmorras y en las misiones, también hay algunas misiones versus que se oponen a los jugadores.
La versión de Wii es en gran medida idéntica a la versión de DS en cuanto a jugabilidad, pero se juega en una sola pantalla. El motor multiconsola permite a los jugadores de las versiones de Wii y DS jugar juntos y los jugadores de Wii pueden crear máscaras basadas en sus Miis.